药枕疗法在临床应用时，应该注意以下几点：
(1)药枕制作除特殊要求外，一般需选用透气性能良好的棉布或纱布做成枕芯，不用尼龙、化纤类布匹。药物一般不可潮湿，否则失效。
(2)药枕不使用时最好用塑料包封，防止有效成分散发，并放置于阴凉干燥处，防止霉变。一般使用2～3周后，应该放在阳光下晾晒几小时，以保持药枕枕形及药物的干燥度。
(3)药枕在枕前一般多要求患者松衣，饮一两杯温开水，防止芳香类药物耗伤阴津。并要求患者全身放松，息心宁神，若能配合内养功、六字诀等气功疗法，效果更好。
(4)药枕疗法的效果缓慢而持久，患者要耐心坚持，决不可3天一枕，5天不用。一般每天至少要枕6小时以上，连续枕之2～3周即见疗效。
(5)对在使用药枕过程中，原发病加重或不改善者，应及时到医院就诊，不能因为单用药枕而延误病情，必须及时采取其他行之有效的中、西医疗法。
(6)急危重症的患者使用药枕，只能作为辅助治疗手段。
